距今大约260万年以来，区内受新构造运动影响，地壳强烈上升，加之区内雨量充沛，地表径流发育，湍急的水流受节理和层面倾向控制，形成扰流和螺旋状涡流，带动砂石在不平坦的河床上如旋涡般钻挖形成一系列壶穴。在经历造山运动后，河床抬升、河流下切，原本位于河床的壶穴被破坏、抬升至崖壁，形成壶穴谷。