三清宫始建于宋代，现在所看到的是明朝景泰年间重建的，距今已有500多年。三清宫选址很有讲究，它建在九龙山的龟背石上，坐南向北。前面有“净衣”、“清华”、“涵星”三池，后面是崇山峻岭和万松林；东有龙首山天然屏障；西面是卧伏拱卫的虎头岩。 三清宫是三清福地中最具代表性的古建筑。它占地2,300平方米，建筑面积518平方米。建筑由木石结构，前面是殿，后面是阁，左右有厢房，形制上与龙虎山的上清宫大体相同。殿内正中供奉着玉清元始天尊、上清灵宝天尊和太清太上老君三位道教正神。 大殿石柱上的两副对联很有意思。一副为“殿开白昼风来扫，门到黄昏云自封”。它既表现了三清山的风云变幻，又蕴含了道家清净无为的意境，十分贴切自然。另一副相传为明建文帝朱允炆潜藏在此时，安身修道，放弃复位念头之后写下的：“三天无极存道气於玉清上清太清，一统大明祝皇祚於百世千世万世”。